Tujuan PMKM Brebes adalah sebagai berikut:
1. Dihasilkannya program pendidikan dan pengajaran secara professional
2. Dihasilkannya kualitas pendidikan dan penerapan ilmu pengetahuan dan teknologi dalam bidang IT dan kesehatan sesuai dengan kebutuhan dan perkembangan industri yang relevan
3. Dihasilkannya penelitian terapan yang menunjang pengembangan ilmu pengetahuan
4. Dihasilkannya kegiatan dan pengabdian masyarakat secara edukatif, konsisten dan terprogram dengan mengacu pada telaah dan kajian dalam berbagai ilmu pengetahuan
5. Terciptanya pengelolaan sumber daya Politeknik untuk mewujudkan kinerja secara efektif, efisien, dan berkelanjutan
6. Terjalinnya Kerjasama dengan berbagai instansi dan lembaga tingkat Regional, Nasional dan Internasional.